Iso-seq数据分析软件

我要开发同款
Colletotrichum2022年04月22日
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作品详情

在下游分析中我们发现官方 Iso-Seq 数据分析软件存在许多问题。同时现阶段 Iso-Seq 转录组分析软件十分匮乏。为此我们开发了 Iso-Seq-Tools 分析工具包 完善了 Iso-Seq 转录组数据加工流程。同时添加对 Iso-Seq 注释文件的基本信息统 计和转录调控事件鉴定的功能。Iso-Seq-Tools 是一款整合的 Iso-Seq 转录组分析 工具,主要功能包括:完善 Iso-Seq 数据全长非嵌合序列 (FLNC) 的矫正过程、 对转录组基本信息、多顺反子转录本、无义介导的 mRNA 降解机制 (NMD) 候 选转录本、可变聚腺苷酸位点进行统计和鉴定。本软件可为研究人员分析 Iso-Seq 转录组提供便利。Iso-Seq-Tools 使用 Python2 语言编写,在 CentOs7.5 操作系统 上成功测试运行。该作品已申请软件著作权,且“Landscape, complexity and regulation of a filamentous fungal transcriptome”已发表。
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