GATK是GeomeAalysisToolKit的缩写,是一款从高通量测序数据中分析变异信息的软件,是目前最主流的spcallig软件之一。GATK设计之初是用于分析人类的全外显子和全基因组数据,随着不断发展,现在也可以用于其它的物种,还支持CNV和SV变异信息的检测。
项目同时提供了完整的分析流程GATKBestPractices。
开源地址
https://github.com/broadinstitute/gatk授权协议
BSD-3-Clause
GATK是GeomeAalysisToolKit的缩写,是一款从高通量测序数据中分析变异信息的软件,是目前最主流的spcallig软件之一。GATK设计之初是用于分析人类的全外显子和全基因组数据,随着不断发展,现在也可以用于其它的物种,还支持CNV和SV变异信息的检测。
项目同时提供了完整的分析流程GATKBestPractices。
GATK 是 Genome Analysis ToolKit 的缩写,是一款从高通量测序数据中分析变异信息的软件,是目前最主流的 snp calling 软件之一。GATK 设计之初是用于分析人...

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