微生物组数据分析综合Python工具包开源项目

微生物组数据分析综合Python工具包。AutoML 模块基于 Andrej Karpathy 提出的 autoresearch范式设计，实现了程序化约束与模型训练解耦的自动化搜索框架。
差异丰度分析: LEfSe, DESeq2, ANCOM-BC
Alpha多样性: Observed, Shannon, Chaol, Simpson 指数
Beta多样性: Bray-Curtis, Jaccard, UniFrac 距离及 PCoA 排序
统计检验: PERMANOVA, ANOSIM
功能预测: PICRUSt2, FAPROTAX 封装
网络分析: Spearman, SparCC 相关性网络
系统发育: 系统发育树构建与Bootstrap支持
预测模型: 疾病分类、疗效预测、预后生存模型 (ML/DL)
多组学整合: 16S + 代谢组 + 宏基因组融合分析 (DIABLO, CCA, Procrustes, Early/Late Fusion)